寶德推出科學計算HPC解決方案

　　寶德針對國內(nèi)科研院所的科學計算需求，推出了針對物理和化學計算的HPC解決方案。寶德技術(shù)專家分析，大部分物理化學軟件都是MPI并行程序，并行加速比較好，通常可以擴展到32~128進程以上，程序運行方式通常是跨節(jié)點并行運行;從并行算法分析，計算材料軟件的進程間通信比較頻繁，屬于通信密集型應用。因此，節(jié)點間網(wǎng)絡的延遲和帶寬對程序的并行加速比起著決定性的作用。使用傳統(tǒng)的千兆以太網(wǎng)很難發(fā)揮程序的并行性能，跨節(jié)點運行時會導致嚴重的性能下降，成為整個計算過程的瓶頸。這樣推薦用戶使用高帶寬、低延遲的InfiniBand網(wǎng)絡。

　　寶德典型的物理化學計算集群系統(tǒng)包括登錄節(jié)點，計算節(jié)點，存儲節(jié)點和交換系統(tǒng)，并且具有優(yōu)異的性能和良好的擴展性。計算節(jié)點選用寶德高密度服務器平臺，1U雙路多節(jié)點服務器PR1720H，滿足一般計算軟件和計算任務的需求;計算系統(tǒng)還可以根據(jù)需要配置幾臺四路或八路SMP胖節(jié)點，專為Gaussian等OpenMP并行程序或其它一些大內(nèi)存應用配備。集群系統(tǒng)配置了兩臺寶德PR2510V服務器作為管理登錄節(jié)點，兩臺登錄管理節(jié)點配置雙機熱備，對作業(yè)調(diào)度、用戶管理等系統(tǒng)服務實現(xiàn)雙保險，提高整個集群的高可用性。

　　計算網(wǎng)絡采用高帶寬、低延遲的QDR InfiniBand網(wǎng)絡，為并行程序提供無阻塞的通信高速通道;另外，配置一套或兩套千兆網(wǎng)絡，用于集群管理和監(jiān)控，千兆網(wǎng)絡也可作為備用計算網(wǎng)絡，提高系統(tǒng)的高可用性;存儲系統(tǒng)采用寶德GS-5120 FC/iSCSI-SAN磁盤陣列,提供了海量數(shù)據(jù)存儲能力的同時，其創(chuàng)新的RAID 級別提供了更高的數(shù)據(jù)保護功能。強大的硬件設(shè)計，靈活的擴展操作和友好的管理界面，為客戶不同應用提供簡單方便的解決方案。

　　本方案選擇了業(yè)界領(lǐng)先的寶德PR7010B刀片服務器，采用最新的處理器架構(gòu)，計算網(wǎng)絡使用40Gb的QDR Infiniband，非常適合計算物理、計算化學這樣的計算密集型和通信密集 型應用;大容量、高性能、高容錯、高可擴展性的分布式并行存儲系統(tǒng)為集群提供了強大的存儲支持。冗余電源，熱插拔硬盤，高可靠的服務器存儲系統(tǒng)等設(shè)備和技術(shù)保證系統(tǒng)的可靠穩(wěn)定運行;雙登錄管理節(jié)點、備用計算網(wǎng)絡、存儲系統(tǒng)的高容錯技術(shù)為集群的提供了更高的可靠性。

　　寶德物理化學計算HPC解決方案不僅保障現(xiàn)有條件下的高性能計算，并且綠色節(jié)能，實現(xiàn)彈性部署。系統(tǒng)設(shè)計為用戶預留了自由的可擴展空間，用戶可根據(jù)業(yè)務系統(tǒng)的增長，靈活地增配計算節(jié)點，擴充計算網(wǎng)絡，提升計算性能;擴充存儲系統(tǒng)的容量和性能，滿足增長的數(shù)據(jù)存放和IO性能需求。另外集群還引入寶德PDCM智能功耗控制系統(tǒng)能夠根據(jù)集群負載實時調(diào)整整個系統(tǒng)功耗，在不影響集群性能的情況下實現(xiàn)20%節(jié)能，真正實現(xiàn)綠色高效能計算。

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